هدف کلی:
انجام تحقیقات برای پیشگیری از سرطان و کاهش میزان بروز و شیوع آن، درمان مناسب بیماران سرطانی و مراقبت از بیماری و توانبخشی بیماران .

اهداف اختصاصی:
- کمک به ثبت موارد سرطان در کشور ومنطقه
- انجام پژوهشهای پیشگیری و کاربردی برای شناخت عوامل خطر موجد سرطانها

- ارائه راه حل های کاربردی برای کاهش عوامل خطر در سطح ملی ،دانشگاهی و فردی مبتنی بر شواهد تحقیقی
- تدوین پروتکل های آموزشی عمومی مردم ،نیروهای بهداشتی درمانی ،سیاستگذاران و سیاستمداران بر اساس یافته های پژوهشی مبتنی بر شواهد.
- تدوین پروتکل های درمانی براساس تحقیقات انجام شده و موقعیت های اقتصادی و اجتماعی کشور
- تعیین هزینه –اثربخشی اقدامات تشخیصی درمانی بویژه داروهای ضد سرطان
- تدوین پروتکل های علمی بر پایه یافته های پژوهشی برای درمان تسکینی مبتلایان .
- پژوهش های کاربردی  برای تامین سلامت روانی ،اجتماعی و اقتصادی مبتلایان به سرطان
- تلاش در ایجاد شبکه همکاری بین مراکز تحقیقاتی و اجرایی کشور .
- برقراری رابطه با مراکز علمی ،تحقیقاتی ،اجرایی و بین المللی بویژه در منطقه با رعایت قوانین جاری در جمهوری اسلامی ایران.
- تسهیل زمینه های همکاری بین بخشی و کار گروهی برای مراقبت از سرطان ها

سرطان بیماری نیست که از دید مسوولین اجرائی و سیاستگذاران سلامت دور بماند؛ چهارمین عامل بار بیماری ها و سومین علت مرگ در کشور است. شاید هیچ بیماری واگیر و غیر واگیری به اندازه سرطان دارای ابعاد وسیع اجتماعی، اقتصادی، فرهنگی در کنار ابعاد جسمی و روانی آن نباشد.
روند صعودی شیوع سرطان در کشور ما را بر آن داشت که تامین، حفظ و ارتقاء سطح سلامت ملی با حفظ کامل کرامت انسانی با استفاده از بهره گیری از آخرین متد و روش های علمی را سر لوحه کار خود قرار دهیم و بکوشیم تا هزینه اثر بخشی این بیماری را تا حد امکان ارتقاء بخشیم. ما می دانیم برای مهارسیل عظیم سرطان در کشور نیاز به یک بسیج ملی در بین همه آحاد مردم، پزشکان، محققین، سیاستگذاران و دولتمردان و خیرین است.مرکز تحقیقات سرطان با داشتن امکانات مختلف علمی، تحقیقاتی، درمانی و توان بخشی محل مناسبی برای بر قراری ارتباط بین همه گروه های مختلف تحقیقاتی، خدماتی و مردمی است.